Mus musculus Gene: Tdgf1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-202568.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tdgf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | teratocarcinoma-derived growth factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CR1; cripto | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
teratocarcinoma-derived growth factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000241186:
This gene encodes an epidermal growth factor-related protein that contains a cripto, FRL-1, and cryptic domain. The encoded protein is an extracellular, membrane-bound signaling protein that plays an essential role in embryonic development and tumor growth. Mutations in this gene are associated with forebrain defects. Pseudogenes of this gene are found on chromosomes 2, 3, 6, 8, 19 and X. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:110939610-110946158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Regulation of signaling by NODAL pathway
Signaling by NODAL pathway
Developmental Biology pathway
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells pathway
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Glypican 1 network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q7TQ06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.390871 Mm.405815 Mm.5090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tdgf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC118727 AC139378 BC052646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH52646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 21667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||