Mus musculus Gene: Mlh1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-202755.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Mlh1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | mutL homolog 1 (E. coli) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110035C23Rik; AI317206; AI325952; AI561766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
mutL homolog 1 (E. coli)
mutL homolog 1 (E. coli)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000076242:
This gene was identified as a locus frequently mutated in hereditary nonpolyposis colon cancer (HNPCC). It is a human homolog of the E. coli DNA mismatch repair gene mutL, consistent with the characteristic alterations in microsatellite sequences (RER+phenotype) found in HNPCC. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Additional transcript variants have been described, but their full-length natures have not been determined.[provided by RefSeq, Nov 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:111228228-111271608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 135 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Meiotic Recombination pathway
Mus musculus biological processes pathway
Cell Cycle pathway
DNA Repair pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) pathway
Mismatch Repair pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Meiosis pathway
Meiotic recombination pathway
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KEGG |
Endometrial cancer pathway
Colorectal cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Meiotic recombination pathway
Cell Cycle pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) pathway
Mismatch Repair pathway
Meiosis pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Endometrial cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Direct p53 effectors
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9JK91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F6R1G0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 17350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.486383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_026810 XM_006511946 XM_006511947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:101938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Mlh1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC126677 AC132832 AF250844 AK168849 U59881 U59882 U59883 U59884 U60872 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC52672 AAF64514 BAE40671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 17350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||