Mus musculus Gene: Usf1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204574.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Usf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | upstream transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHb11 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026641 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
upstream transcription factor 1
upstream transcription factor 1
upstream transcription factor 1
upstream transcription factor 1
upstream transcription factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000158773:
This gene encodes a member of the basic helix-loop-helix leucine zipper family, and can function as a cellular transcription factor. The encoded protein can activate transcription through pyrimidine-rich initiator (Inr) elements and E-box motifs. This gene has been linked to familial combined hyperlipidemia (FCHL). Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been defined on chromosome 21. [provided by RefSeq, Feb 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:171411313-171420352 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | H3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 52 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling mediated by p38-alpha and p38-beta
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.410390 Mm.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001164525 NM_009480 XM_006496747 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15495 CCDS48443 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||