Mus musculus Gene: Rrbp1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-208377.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rrbp1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosome binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1700087N07Rik; 5730465C04Rik; ES/130; mKIAA1398; mRRp0; mRRp1.8; mRRp10; mRRp15a; mRRp15b; mRRp16.8; mRRp2; mRRp41; mRRp47; mRRp5.4; p180 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027422 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribosome binding protein 1
ribosome binding protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000125844:
This gene encodes a ribosome-binding protein of the endoplasmic reticulum (ER) membrane. Studies suggest that this gene plays a role in ER proliferation, secretory pathways and secretory cell differentiation, and mediation of ER-microtubule interactions. Alternative splicing has been observed and protein isoforms are characterized by regions of N-terminal decapeptide and C-terminal heptad repeats. Splicing of the tandem repeats results in variations in ribosome-binding affinity and secretory function. The full-length nature of variants which differ in repeat length has not been determined. Pseudogenes of this gene have been identified on chromosomes 3 and 7, and RRBP1 has been excluded as a candidate gene in the cause of Alagille syndrome, the result of a mutation in a nearby gene on chromosome 20p12. [provided by RefSeq, Apr 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:143947395-144011263 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | G1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.13705 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_024281 NM_133626 XM_006500441 XM_006500444 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38252 CCDS38253 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||