Homo sapiens Gene: PTPRO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-21457.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PTPRO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | protein tyrosine phosphatase, receptor type, O | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | GLEPP1; NPHS6; PTP-OC; PTP-U2; PTPROT; PTPU2; R-PTP-O | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000151490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
protein tyrosine phosphatase, receptor type, O
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the R3 subtype family of receptor-type protein tyrosine phosphatases. These proteins are localized to the apical surface of polarized cells and may have tissue-specific functions through activation of Src family kinases. This gene contains two distinct promoters, and alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed. The encoded proteins may have multiple isoform-specific and tissue-specific functions, including the regulation of osteoclast production and activity, inhibition of cell proliferation and facilitation of apoptosis. This gene is a candidate tumor suppressor, and decreased expression of this gene has been observed in several types of cancer. [provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:15322397-15597399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p12.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 37 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by Stem cell factor receptor (c-Kit)
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q16827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024RAS9 B4DS16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.160871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_030669 NM_002848 NM_030667 NM_030668 NM_030670 NM_030671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44837 CCDS53754 CCDS8674 CCDS8675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC007542 AC022334 AC092183 AF187043 AF187044 AK290982 AK299529 BC035960 BC126201 BC126203 CH471094 U20489 Z48541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA82892 AAF04086 AAF04087 AAH35960 AAI26202 AAI26204 BAF83671 BAG61478 CAA88425 EAW96349 EAW96350 EAW96351 EAW96352 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||