Homo sapiens Gene: LAT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-239499.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | linker for activation of T cells | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000213658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
linker for activation of T cells
linker for activation of T cells
linker for activation of T cells
linker for activation of T cells
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure |
![]() |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
LAT dephosphorylation in human platelets is integrin-mediated and involves PTPN1 protein tyrosine phosphatase and both PTPN1 activation and LAT dephosphorylation processes were involved in the control of irreversible platelet aggregation upon FcgammaRIIa stimulation.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is phosphorylated by ZAP-70/Syk protein tyrosine kinases following activation of the T-cell antigen receptor (TCR) signal transduction pathway. This transmembrane protein localizes to lipid rafts and acts as a docking site for SH2 domain-containing proteins. Upon phosphorylation, this protein recruits multiple adaptor proteins and downstream signaling molecules into multimolecular signaling complexes located near the site of TCR engagement. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:28984826-28990783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p11.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 66 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Method
Confidence
Comments
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
KitReceptor pathway
TCR pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TCR signaling pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
Generation of second messenger molecules pathway
Hemostasis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
T cell receptor signaling pathway pathway
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
CD4 T cell receptor signaling pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID BIOCARTA |
Ras-independent pathway in nk cell-mediated cytotoxicity
[Biocarta view]
Role of mef2d in t-cell apoptosis
[Biocarta view]
T cell receptor signaling pathway
[Biocarta view]
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
TCR signaling in naïve CD8+ T cells
TCR signaling in naïve CD4+ T cells
Signaling events mediated by PTP1B
JNK signaling in the CD4+ TCR pathway
Fc-epsilon receptor I signaling in mast cells
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O43561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 27040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_014387 NM_001014989 NM_001014987 NM_001014988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45455 CCDS10647 CCDS53999 CCDS32425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC109460 AF036905 AF036906 AJ223280 BC011563 CH471267 FN432832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC39636 AAC39637 AAH11563 CAA11218 CBA11533 EAW52027 EAW52028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 27040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||