Homo sapiens Gene: CROT | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24917.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CROT | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | carnitine O-octanoyltransferase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000005469 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
carnitine O-octanoyltransferase
carnitine O-octanoyltransferase
carnitine O-octanoyltransferase
carnitine O-octanoyltransferase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the carnitine/choline acetyltransferase family. The encoded protein converts 4,8-dimethylnonanoyl-CoA to its corresponding carnitine ester. This transesterification occurs in the peroxisome and is necessary for transport of medium- and long- chain acyl-CoA molecules out of the peroxisome to the cytosol and mitochondria. The protein thus plays a role in lipid metabolism and fatty acid beta-oxidation. Alternatively spliced transcript variants have been described.[provided by RefSeq, Jan 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:87345681-87399795 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.12 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Beta-oxidation of pristanoyl-CoA pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.125039 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001143935 NM_001243745 NM_021151 XM_006716031 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47634 CCDS5604 CCDS59062 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 12081 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||