Homo sapiens Gene: OCLN | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-26117.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | OCLN | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | occludin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000197822 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
occludin
occludin
occludin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an integral membrane protein that is required for cytokine-induced regulation of the tight junction paracellular permeability barrier. Mutations in this gene are thought to be a cause of band-like calcification with simplified gyration and polymicrogyria (BLC-PMG), an autosomal recessive neurologic disorder that is also known as pseudo-TORCH syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene is present 1.5 Mb downstream on the q arm of chromosome 5. [provided by RefSeq, Apr 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:69492292-69558104 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Apoptosis pathway
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KEGG |
Pathogenic Escherichia coli infection pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
TGF-beta receptor signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q16625 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 100506658 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.592605 Hs.610669 Hs.671081 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205254 NM_001205255 NM_002538 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8104 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602876 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4006 CCDS54864 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB451306 AB451437 AC145146 AC147575 AF400623 AF400624 AF400625 AF400626 AF400627 AF400628 AF400629 AF400630 BC029886 BK001650 FJ786083 FJ786084 GQ225096 GQ225097 GQ225098 GQ402517 U49184 U53823 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB00195 AAC50451 AAH29886 AAL47094 ACT53743 ACT53744 ACT83431 ACT83432 ACT83433 ACZ80515 BAG70120 BAG70251 DAA01837 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 100506658 | ||||||||||||||||||||||