Homo sapiens Gene: CTIF | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-3179.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CTIF | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | CBP80/20-dependent translation initiation factor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gm672; KIAA0427 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000134030 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CBP80/20-dependent translation initiation factor
CBP80/20-dependent translation initiation factor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
CTIF is a component of the CBP80 (NCBP1; MIM 600469)/CBP20 (NCBP2; MIM 605133) translation initiation complex that binds cotranscriptionally to the cap end of nascent mRNA. The CBP80/CBP20 complex is involved in a simultaneous editing and translation step that recognizes premature termination codons (PTCs) in mRNAs and directs PTC-containing mRNAs toward nonsense-mediated decay (NMD). On mRNAs without PTCs, the CBP80/CBP20 complex is replaced with cytoplasmic mRNA cap-binding proteins, including EIF4G (MIM 600495), and steady-state translation of the mRNAs resumes in the cytoplasm (Kim et al., 2009 [PubMed 19648179]).[supplied by OMIM, Dec 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:48539046-48863217 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.145230 Hs.611200 Hs.623413 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001142397 NM_014772 XM_006722587 XM_006722588 XM_006722589 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11935 CCDS45864 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11083 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||