Homo sapiens Gene: UBE2D3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32113.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | UBE2D3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | E2(17)KB3; UBC4/5; UBCH5C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000109332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The modification of proteins with ubiquitin is an important cellular mechanism for targeting abnormal or short-lived proteins for degradation. Ubiquitination involves at least three classes of enzymes: ubiquitin-activating enzymes, or E1s, ubiquitin-conjugating enzymes, or E2s, and ubiquitin-protein ligases, or E3s. This gene encodes a member of the E2 ubiquitin-conjugating enzyme family. This enzyme functions in the ubiquitination of the tumor-suppressor protein p53, which is induced by an E3 ubiquitin-protein ligase. Multiple spliced transcript variants have been found for this gene, but the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:102794383-102868896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 248 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
IKK complex recruitment mediated by RIP1 pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity pathway
Signaling by BMP pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha pathway
Cellular responses to stress pathway
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Loss of Function of SMAD4 in Cancer pathway
Loss of Function of SMAD2/3 in Cancer pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex in Cancer pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Transcriptional activity of SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer pathway
SMAD2/3 MH2 Domain Mutants in Cancer pathway
Loss of Function of TGFBR2 in Cancer pathway
Adaptive Immune System pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Immune System pathway
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer pathway
Cellular response to hypoxia pathway
TGFBR1 KD Mutants in Cancer pathway
Activated TLR4 signalling pathway
Loss of Function of TGFBR1 in Cancer pathway
TGFBR1 LBD Mutants in Cancer pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
TGFBR2 Kinase Domain Mutants in Cancer pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
Signaling by TGF-beta Receptor Complex pathway
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KEGG |
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Canonical NF-kappaB pathway
BARD1 signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.518773 Hs.595430 Hs.595816 Hs.598998 Hs.604237 Hs.732195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001300795 NM_003340 NM_181886 NM_181887 NM_181888 NM_181889 NM_181890 NM_181891 NM_181892 NM_181893 XM_005263200 XM_005263205 XM_006714297 XM_006714298 XM_006714299 XM_006714300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3659 CCDS3660 CCDS3661 CCDS75172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||