Homo sapiens Gene: PAN2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40746.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PAN2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | USP52 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000135473 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae)
PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae)
PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae)
PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae)
PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae)
PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a deadenylase that functions as the catalytic subunit of the polyadenylate binding protein dependent poly(A) nuclease complex. The encoded protein is a magnesium dependent 3' to 5' exoribonuclease that is involved in the degradation of cytoplasmic mRNAs. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009] This gene encodes a deadenylase that functions as the catalytic subunit of the polyadenylate binding protein dependent poly(A) nuclease complex. The encoded protein is a magnesium dependent 3\' to 5\' exoribonuclease that is involved in the degradation of cytoplasmic mRNAs. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:56316223-56334053 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q13.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 344 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Deadenylation of mRNA pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.273397 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001127460 NM_001166279 NM_014871 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44922 CCDS53802 CCDS8915 | ||||||||||||||||||
HPRD | 15640 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||