Homo sapiens Gene: PDCD6 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-409259.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PDCD6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | programmed cell death 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ALG-2; PEF1B | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000249915 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
programmed cell death 6
programmed cell death 6
programmed cell death 6
programmed cell death 6
programmed cell death 6
programmed cell death 6
programmed cell death 6
programmed cell death 6
programmed cell death 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a calcium-binding protein belonging to the penta-EF-hand protein family. Calcium binding is important for homodimerization and for conformational changes required for binding to other protein partners. This gene product participates in T cell receptor-, Fas-, and glucocorticoid-induced programmed cell death. In mice deficient for this gene product, however, apoptosis was not blocked suggesting this gene product is functionally redundant. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is also located on the short arm of chromosome 5. [provided by RefSeq, May 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:271621-353856 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 51 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001267556 NM_001267557 NM_001267558 NM_001267559 NM_013232 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3854 CCDS58940 CCDS58941 CCDS75222 CCDS75223 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03035 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||