Homo sapiens Gene: SNRPB | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-41346.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRPB | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | COD; Sm-B/B\'; SmB/B\'; SmB/SmB\'; snRNP-B; SNRPB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000125835 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1
small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1
small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1
small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is one of several nuclear proteins that are found in common among U1, U2, U4/U6, and U5 small ribonucleoprotein particles (snRNPs). These snRNPs are involved in pre-mRNA splicing, and the encoded protein may also play a role in pre-mRNA splicing or snRNP structure. Autoantibodies from patients with systemic lupus erythematosus frequently recognize epitopes on the encoded protein. Two transcript variants encoding different isoforms (B and B') have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is one of several nuclear proteins that are found in common among U1, U2, U4/U6, and U5 small ribonucleoprotein particles (snRNPs). These snRNPs are involved in pre-mRNA splicing, and the encoded protein may also play a role in pre-mRNA splicing or snRNP structure. Autoantibodies from patients with systemic lupus erythematosus frequently recognize epitopes on the encoded protein. Two transcript variants encoding different isoforms (B and B\') have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:2461634-2470853 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 113 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
snRNP Assembly pathway
SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs pathway
SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Systemic lupus erythematosus pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003091 NM_198216 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13026 CCDS13027 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01655 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||