Homo sapiens Gene: VLDLR | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-44752.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VLDLR | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | very low density lipoprotein receptor | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CARMQ1; CHRMQ1; VLDLRCH | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000147852 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
very low density lipoprotein receptor
very low density lipoprotein receptor
very low density lipoprotein receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
VLDLR is exploited by rhinovirus for viral entry. VLDLR protein levels are negatively regulated by IFN/RIG-I signalling via MIR23B.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Vldlr is exploited by rhinovirus for viral entry. Vldlr protein levels are negatively regulated by IFN/RIG-I signalling via MIR23B. (Demonstrated in human)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The low density lipoprotein receptor (LDLR) gene family consists of cell surface proteins involved in receptor-mediated endocytosis of specific ligands. This gene encodes a lipoprotein receptor that is a member of the LDLR family and plays important roles in VLDL-triglyceride metabolism and the reelin signaling pathway. Mutations in this gene cause VLDLR-associated cerebellar hypoplasia. Alternative splicing generates multiple transcript variants encoding distinct isoforms for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:2621834-2660053 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | p24.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Reelin signaling pathway
Urokinase-type plasminogen activator (uPA) and uPAR-mediated signaling
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P98155 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A8K0G2 Q5VVF5 Q5VVF8 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7436 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.370422 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001018056 NM_003383 XM_006716864 XM_006716865 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12698 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 192977 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34979 CCDS6446 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK289527 AL450467 BC136562 BC142653 BC144245 CH471071 D16493 D16494 D16532 DQ067198 L20470 L22431 S73849 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA53684 AAA61344 AAB31735 AAI36563 AAI42654 AAI44246 AAY46157 BAA03945 BAA03946 BAA03969 BAF82216 CAH72454 EAW58804 EAW58805 EAW58806 EAW58807 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7436 | ||||||||||||||||||||||||||||