Homo sapiens Gene: CD47 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-48744.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CD47 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | CD47 molecule | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IAP; MER6; OA3 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000196776 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CD47 molecule
CD47 molecule
CD47 molecule
CD47 molecule
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Cd47 plays a protective role against disseminated candidiasis and alters pro-inflammatory and immunosuppressive pathways known to regulate innate and T cell immunity.
[Mus musculus] Cd47 plays a role as a negative regulator in inducing protective immune responses to influenza vaccination.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a membrane protein, which is involved in the increase in intracellular calcium concentration that occurs upon cell adhesion to extracellular matrix. The encoded protein is also a receptor for the C-terminal cell binding domain of thrombospondin, and it may play a role in membrane transport and signal transduction. This gene has broad tissue distribution, and is reduced in expression on Rh erythrocytes. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:108043298-108091025 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q13.12 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Signal regulatory protein (SIRP) family interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Extracellular matrix organization pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta3 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.674188 Hs.702403 Hs.713993 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001777 NM_198793 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43125 CCDS43126 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03017 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||