Version 5.4
| Homo sapiens Gene: PRPF18 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-55250.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | PRPF18 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | hPrp18; PRP18 | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000165630 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae)
PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae)
PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae)
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
Pre-mRNA splicing occurs in 2 sequential transesterification steps. The protein encoded by this gene is found to be essential for the catalytic step II in pre-mRNA splicing process. It is found in the spliceosome, and contains seven WD repeats, which function in protein-protein interactions. This protein has a sequence similarity to the yeast splicing factor Prp18. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 10:13586927-13630868 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | p13 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME | |||||||||||||||||||
| KEGG |
Spliceosome pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q5T9P7 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 8559 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.729158 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_003675 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:17351 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 604993 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS7100 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 05407 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AL157392 | ||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 8559 | ||||||||||||||||||