Homo sapiens Gene: VIM | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-58574.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VIM | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | vimentin | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CTRCT30; HEL113 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000026025 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vimentin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the intermediate filament family. Intermediate filamentents, along with microtubules and actin microfilaments, make up the cytoskeleton. The protein encoded by this gene is responsible for maintaining cell shape, integrity of the cytoplasm, and stabilizing cytoskeletal interactions. It is also involved in the immune response, and controls the transport of low-density lipoprotein (LDL)-derived cholesterol from a lysosome to the site of esterification. It functions as an organizer of a number of critical proteins involved in attachment, migration, and cell signaling. Mutations in this gene causes a dominant, pulverulent cataract.[provided by RefSeq, Jun 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:17228259-17237593 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 278 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Alpha6Beta4Integrin pathway
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Striated Muscle Contraction pathway
Apoptosis pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
Aurora B signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B0YJC5 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7431 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.455493 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003380 XM_006717500 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12692 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 193060 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7120 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01899 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL133415 EF445046 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | ACA06100 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7431 | ||||||||||||||||||||||||