Homo sapiens Gene: CALM3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-58805.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CALM3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | calmodulin 3 (phosphorylase kinase, delta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CALML2; caM; CAMI; CAMII; CPVT4; DD132; HEL-S-72; PHKD; PHKD2; PHKD3; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000160014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
calmodulin 3 (phosphorylase kinase, delta)
calmodulin 3 (phosphorylase kinase, delta)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the EF-hand calcium-binding protein family. It is one of three genes which encode an identical calcium binding protein which is one of the four subunits of phosphorylase kinase. Two pseudogenes have been identified on chromosome 7 and X. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:46601074-46610793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 22 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
Method
Confidence
Comments
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by FGFR in disease pathway
Activation of CaMK IV pathway
CaM pathway pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by EGFR in Cancer pathway
Downstream signaling of activated FGFR pathway
Ca2+ pathway pathway
Phospholipase C-mediated cascade pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
beta-catenin independent WNT signaling pathway
eNOS activation and regulation pathway
DAP12 signaling pathway
Signaling by Wnt pathway
Neuronal System pathway
Signaling by VEGF pathway
Signaling by EGFR pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
Signaling by GPCR pathway
Innate Immune System pathway
PLC beta mediated events pathway
Metabolism of nitric oxide pathway
Ionotropic activity of Kainate Receptors pathway
Platelet degranulation pathway
Glycogen breakdown (glycogenolysis) pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
VEGFR2 mediated vascular permeability pathway
CaMK IV-mediated phosphorylation of CREB pathway
PLC-gamma1 signalling pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
Opioid Signalling pathway
Smooth Muscle Contraction pathway
DAG and IP3 signaling pathway
Signal Transduction pathway
Cam-PDE 1 activation pathway
Post NMDA receptor activation events pathway
Ras activation uopn Ca2+ infux through NMDA receptor pathway
G-protein mediated events pathway
Activation of Kainate Receptors upon glutamate binding pathway
Adaptive Immune System pathway
Diseases associated with visual transduction pathway
Immune System pathway
CREB phosphorylation through the activation of CaMKK pathway
Downstream signal transduction pathway
VEGFR2 mediated cell proliferation pathway
Activation of NMDA receptor upon glutamate binding and postsynaptic events pathway
CREB phosphorylation through the activation of Ras pathway
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers pathway
VEGFA-VEGFR2 Pathway pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
NGF signalling via TRKA from the plasma membrane pathway
Translocation of GLUT4 to the plasma membrane pathway
Visual phototransduction pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Activation of Ca-permeable Kainate Receptor pathway
Signaling by FGFR pathway
Muscle contraction pathway
Inositol phosphate metabolism pathway
The phototransduction cascade pathway
Signaling by PDGF pathway
Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation pathway
Signaling by ERBB2 pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
Metabolism pathway
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade pathway
FCERI mediated Ca+2 mobilization pathway
DARPP-32 events pathway
Signaling by the B Cell Receptor (BCR) pathway
PLCG1 events in ERBB2 signaling pathway
Ca-dependent events pathway
Calmodulin induced events pathway
CREB phosphorylation through the activation of CaMKII pathway
Disease pathway
Glucose metabolism pathway
Glycogen storage diseases pathway
Hemostasis pathway
DAP12 interactions pathway
Membrane Trafficking pathway
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol pathway
EGFR interacts with phospholipase C-gamma pathway
eNOS activation pathway
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KEGG |
Calcium signaling pathway pathway
Phosphatidylinositol signaling system pathway
Oocyte meiosis pathway
Vascular smooth muscle contraction pathway
Long-term potentiation pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Olfactory transduction pathway
Phototransduction pathway
Insulin signaling pathway pathway
GnRH signaling pathway pathway
Melanogenesis pathway
Salivary secretion pathway
Gastric acid secretion pathway
Alzheimer's disease pathway
Glioma pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID BIOCARTA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.515487 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||