Homo sapiens Gene: SNRNP200 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-61602.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRNP200 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein 200kDa (U5) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ASCC3L1; BRR2; HELIC2; RP33; U5-200KD | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000144028 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein 200kDa (U5)
small nuclear ribonucleoprotein 200kDa (U5)
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Pre-mRNA splicing is catalyzed by the spliceosome, a complex of specialized RNA and protein subunits that removes introns from a transcribed pre-mRNA segment. The spliceosome consists of small nuclear RNA proteins (snRNPs) U1, U2, U4, U5 and U6, together with approximately 80 conserved proteins. U5 snRNP contains nine specific proteins. This gene encodes one of the U5 snRNP-specific proteins. This protein belongs to the DEXH-box family of putative RNA helicases. It is a core component of U4/U6-U5 snRNPs and appears to catalyze an ATP-dependent unwinding of U4/U6 RNA duplices. Mutations in this gene cause autosomal-dominant retinitis pigmentosa. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found, but the full-length nature of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Mar 2010] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:96274336-96305515 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 157 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.246112 Hs.609834 Hs.612595 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_014014 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2020 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03391 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||