Bos taurus Gene: LYST | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-628493.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LYST | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysosomal-trafficking regulator | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CHS1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000016804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysosomal-trafficking regulator
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143669:
This gene is thought to encode a protein that regulates intracellular protein trafficking to and from the lysosome. Mutations in this gene are associated with Chediak-Higashi syndrome, a rare lysosomal storage disorder. Alternatively spliced transcript variants have been described but their full-length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a protein that regulates intracellular protein trafficking in endosomes, and may be involved in pigmentation. Mutations in this gene are associated with Chediak-Higashi syndrome, a lysosomal storage disorder. Alternative splicing results in multiple transcript variants, though the full-length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Apr 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 28:8423715-8567655 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A5JIU1 F1MLZ4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 281072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.4767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174020 XM_005226205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02061466 EF519914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | ABQ45357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 281072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||