Bos taurus Gene: ZBTB16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-630682.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ZBTB16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger and BTB domain-containing protein 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000011266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
zinc finger and BTB domain-containing protein 16
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] MIR146A upregulation by CXCR4 antagonist AMD3100 treatment or ZBTB16 silencing, decreases CXCR4 protein expression and prevents HIV-1 infection of leukemic monocytic cell line and CD4(+) T lymphocytes.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000109906:
This gene is a member of the Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family and encodes a zinc finger transcription factor that contains nine Kruppel-type zinc finger domains at the carboxyl terminus. This protein is located in the nucleus, is involved in cell cycle progression, and interacts with a histone deacetylase. Specific instances of aberrant gene rearrangement at this locus have been associated with acute promyelocytic leukemia (APL). Alternate transcriptional splice variants have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:24917133-25116350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 107 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Acute myeloid leukemia pathway
Pathways in cancer pathway
Acute myeloid leukemia pathway
Pathways in cancer pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q32PJ4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 534401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.46458 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037476 XM_005215849 XM_005215850 XM_005215851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC108094 DAAA02040321 DAAA02040322 DAAA02040323 GJ062397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI08095 DAA22386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 534401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||