Bos taurus Gene: PSEN2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631143.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PSEN2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Presenilin-2 Presenilin-2 NTF subunit Presenilin-2 CTF subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000013197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Presenilin-2Presenilin-2 NTF subunitPresenilin-2 CTF subunit
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Psen2 deficiency is paralleled by reduced transcription of Tlr4 mRNA and loss of LPS-induced Tlr4 mRNA transcription regulation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000143801:
Alzheimer's disease (AD) patients with an inherited form of the disease carry mutations in the presenilin proteins (PSEN1 or PSEN2) or the amyloid precursor protein (APP). These disease-linked mutations result in increased production of the longer form of amyloid-beta (main component of amyloid deposits found in AD brains). Presenilins are postulated to regulate APP processing through their effects on gamma-secretase, an enzyme that cleaves APP. Also, it is thought that the presenilins are involved in the cleavage of the Notch receptor such that, they either directly regulate gamma-secretase activity, or themselves act are protease enzymes. Two alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms of PSEN2 have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] Alzheimer\'s disease (AD) patients with an inherited form of the disease carry mutations in the presenilin proteins (PSEN1 or PSEN2) or the amyloid precursor protein (APP). These disease-linked mutations result in increased production of the longer form of amyloid-beta (main component of amyloid deposits found in AD brains). Presenilins are postulated to regulate APP processing through their effects on gamma-secretase, an enzyme that cleaves APP. Also, it is thought that the presenilins are involved in the cleavage of the Notch receptor such that, they either directly regulate gamma-secretase activity, or themselves act are protease enzymes. Two alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms of PSEN2 have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:30596049-30622404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 53 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus pathway
Signaling by NOTCH pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by ERBB4 pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
NRIF signals cell death from the nucleus pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
Signaling by NOTCH3 pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Axon guidance pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
Signalling by NGF pathway
Regulated proteolysis of p75NTR pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH4 pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Nuclear signaling by ERBB4 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH2 pathway
Disease pathway
Developmental Biology pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
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REACTOME |
Regulated proteolysis of p75NTR pathway
NRIF signals cell death from the nucleus pathway
Nuclear signaling by ERBB4 pathway
Signaling by ERBB4 pathway
Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus pathway
Signaling by NOTCH4 pathway
Signaling by NOTCH3 pathway
NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Developmental Biology pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Axon guidance pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH2 pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
Disease pathway
Nuclear signaling by ERBB4 pathway
Disease pathway
Signaling by ERBB4 pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
EPH-ephrin mediated repulsion of cells pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus pathway
Signaling by NOTCH2 pathway
Signaling by NOTCH3 pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Signaling by NOTCH4 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Axon guidance pathway
Signalling by NGF pathway
Developmental Biology pathway
Regulated proteolysis of p75NTR pathway
Signal Transduction pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
NRIF signals cell death from the nucleus pathway
Signaling by NOTCH pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
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KEGG |
Notch signaling pathway pathway
Alzheimer's disease pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Notch signaling pathway pathway
Alzheimer's disease pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH |
Notch signaling pathway pathway
Notch signaling pathway pathway
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PID NCI |
LKB1 signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.41904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174440 XM_005216794 XM_005216795 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||