Bos taurus Gene: BT.101954 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631435.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.101954 | ||||||||||||||||||
Gene Name | probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000009067 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
probable ATP-dependent RNA helicase DDX6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000110367:
This gene encodes a member of the DEAD box protein family. The protein is an RNA helicase found in P-bodies and stress granules, and functions in translation suppression and mRNA degradation. It is required for microRNA-induced gene silencing. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:29887449-29918570 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 29 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Gene Expression pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BDM8 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 513906 | ||||||||||||||||||
UniGene | Bt.101954 Bt.12357 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001143867 XM_005215940 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2747 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02040478 DAAA02040479 | ||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 513906 | ||||||||||||||||||