Bos taurus Gene: LMNA | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631682.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LMNA | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | prelamin-A/C | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017574 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lamin A/C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000160789:
The nuclear lamina consists of a two-dimensional matrix of proteins located next to the inner nuclear membrane. The lamin family of proteins make up the matrix and are highly conserved in evolution. During mitosis, the lamina matrix is reversibly disassembled as the lamin proteins are phosphorylated. Lamin proteins are thought to be involved in nuclear stability, chromatin structure and gene expression. Vertebrate lamins consist of two types, A and B. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Mutations in this gene lead to several diseases: Emery-Dreifuss muscular dystrophy, familial partial lipodystrophy, limb girdle muscular dystrophy, dilated cardiomyopathy, Charcot-Marie-Tooth disease, and Hutchinson-Gilford progeria syndrome. [provided by RefSeq, Apr 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:14696144-14715262 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 111 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME |
XBP1(S) activates chaperone genes pathway
IRE1alpha activates chaperones pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Metabolism of proteins pathway
Nuclear Envelope Breakdown pathway
Apoptosis pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Breakdown of the nuclear lamina pathway
Nuclear Envelope Reassembly pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Metabolism of proteins pathway
IRE1alpha activates chaperones pathway
Mitotic Metaphase and Anaphase pathway
Depolymerisation of the Nuclear Lamina pathway
XBP1(S) activates chaperone genes pathway
Initiation of Nuclear Envelope Reformation pathway
Mitotic Prophase pathway
Mitotic Anaphase pathway
Apoptotic execution phase pathway
Clearance of Nuclear Envelope Membranes from Chromatin pathway
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KEGG |
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.12411 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001034053 XM_005203620 XM_005203621 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||