Bos taurus Gene: ERCC6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631777.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ERCC6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA excision repair protein ERCC-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000032527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000225830:
This gene encodes a DNA-binding protein that is important in transcription-coupled excision repair. The encoded protein has ATP-stimulated ATPase activity, interacts with several transcription and excision repair proteins, and may promote complex formation at DNA repair sites. Mutations in this gene are associated with Cockayne syndrome type B and cerebrooculofacioskeletal syndrome 1. Naturally-occurring readthrough transcription occurs between this gene and the adjacent PGBD3 gene (GeneID:267004), and results in a fusion protein that shares sequence with the product of each individual gene. The readthrough locus is represented by GeneID:101243544. [provided by RefSeq, Mar 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 28:44015477-44086510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 30 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
Formation of transcription-coupled NER (TC-NER) repair complex pathway
Dual incision reaction in TC-NER pathway
Transcription-coupled NER (TC-NER) pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
Gene Expression pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Nucleotide excision repair pathway
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BFL2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 522908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.29342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02062232 DAAA02062233 DAAA02062234 DAAA02062235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 522908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||