Bos taurus Gene: USH1C | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632403.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | USH1C | ||||||||||||||||||||
Gene Name | harmonin | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000000986 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
harmonin
harmonin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000006611:
This gene encodes a scaffold protein that functions in the assembly of Usher protein complexes. The protein contains PDZ domains, a coiled-coil region with a bipartite nuclear localization signal and a PEST degradation sequence. Defects in this gene are the cause of Usher syndrome type 1C and non-syndromic sensorineural deafness autosomal recessive type 18. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:35500365-35548981 | ||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BK26 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 530709 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.9867 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001035382 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02040586 | ||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 530709 | ||||||||||||||||||||