Bos taurus Gene: COPB1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632899.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | COPB1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Coatomer subunit beta | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000006556 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Coatomer subunit beta
|
||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000129083:
This gene encodes a protein subunit of the coatomer complex associated with non-clathrin coated vesicles. The coatomer complex, also known as the coat protein complex 1, forms in the cytoplasm and is recruited to the Golgi by activated guanosine triphosphatases. Once at the Golgi membrane, the coatomer complex may assist in the movement of protein and lipid components back to the endoplasmic reticulum. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Jan 2009] |
||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:38765050-38800769 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 49 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
COPI Mediated Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
|
||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
COPI Mediated Transport pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
Membrane Trafficking pathway
Membrane Trafficking pathway
Golgi to ER Retrograde Transport pathway
COPI Mediated Transport pathway
|
||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | A0JN39 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 535533 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.22486 Bt.66345 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001078007 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC126502 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI26503 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 535533 | ||||||||||||||||||||||||