Bos taurus Gene: APOD | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-634170.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | APOD | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | apolipoprotein D precursor | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000023600 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apolipoprotein D precursor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000189058:
This gene encodes a component of high density lipoprotein that has no marked similarity to other apolipoprotein sequences. It has a high degree of homology to plasma retinol-binding protein and other members of the alpha 2 microglobulin protein superfamily of carrier proteins, also known as lipocalins. This glycoprotein is closely associated with the enzyme lecithin:cholesterol acyltransferase - an enzyme involved in lipoprotein metabolism. [provided by RefSeq, Aug 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:72670963-72684269 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of fatty acids pathway
Transport of vitamins, nucleosides, and related molecules pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Orphan transporters pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MS32 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 613972 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001076301 XM_005201541 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:612 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02001718 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 613972 | ||||||||||||||||||||||||||