Bos taurus Gene: SEC62 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636577.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEC62 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | translocation protein SEC62 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | TLOC1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000039442 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SEC62 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000008952:
The Sec61 complex is the central component of the protein translocation apparatus of the endoplasmic reticulum (ER) membrane. The protein encoded by this gene and SEC63 protein are found to be associated with ribosome-free SEC61 complex. It is speculated that Sec61-Sec62-Sec63 may perform post-translational protein translocation into the ER. The Sec61-Sec62-Sec63 complex might also perform the backward transport of ER proteins that are subject to the ubiquitin-proteasome-dependent degradation pathway. The encoded protein is an integral membrane protein located in the rough ER. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:98180183-98202494 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Protein export pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
Protein export pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MUP3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 538938 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.27099 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205604 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02002209 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 538938 | ||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
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