Bos taurus Gene: BT.48865 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636894.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.48865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | bile acid receptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000013596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
bile acid receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] NR1H4 is an essential component of a network of nuclear receptors that regulate intestinal innate immunity and homeostasis.
[Mus musculus] The bile acid sensor Nr1h4 (FXR) Is required for immune-regulatory activities of TLR9 in intestinal inflammation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000012504:
This gene encodes a ligand-activated transcription factor, which shares structural features in common with nuclear hormone receptor family, such as a DNA-binding domain that targets the receptor to specific DNA sequences, and a ligand-binding domain, which interacts directly with the ligand and contains a ligand-dependent transcriptional activation domain. This protein functions as a receptor for bile acids, and when bound to bile acids, regulates the expression of genes involved in bile acid synthesis and transport. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:64763619-64815380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
Recycling of bile acids and salts pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Endogenous sterols pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
Cytochrome P450 - arranged by substrate type pathway
Orphan transporters pathway
Metabolism pathway
Biological oxidations pathway
Phase 1 - Functionalization of compounds pathway
Cytochrome P450 - arranged by substrate type pathway
Phase 1 - Functionalization of compounds pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Recycling of bile acids and salts pathway
Orphan transporters pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Endogenous sterols pathway
Synthesis of bile acids and bile salts pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Gene Expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Biological oxidations pathway
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
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KEGG |
Bile secretion pathway
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
RXR and RAR heterodimerization with other nuclear receptor
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.48865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001034708 XM_005206661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||