Bos taurus Gene: IRF4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636960.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IRF4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon regulatory factor 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000002929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon regulatory factor 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] IRF4 participates in the regulation of lymphoid cell apoptosis by modulating the efficiency of the Fas-mediated death signal.
[Homo sapiens] IRF4 provides a positive feedback signal for its own gene expression in dendritic cells (DCs) and the expression of IRF4 mRNA, but not of other IRFs, is specifically up-regulated during DC differentiation.
[Homo sapiens] Following NOD2 activation, IRF4 interacts with MYD88, TRAF6, and RIPK2 and downregulates K63-linked polyubiquitinylation of RICK and TRAF6 leading to disruption of NFkB activation pathways.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000137265:
The protein encoded by this gene belongs to the IRF (interferon regulatory factor) family of transcription factors, characterized by an unique tryptophan pentad repeat DNA-binding domain. The IRFs are important in the regulation of interferons in response to infection by virus, and in the regulation of interferon-inducible genes. This family member is lymphocyte specific and negatively regulates Toll-like-receptor (TLR) signaling that is central to the activation of innate and adaptive immune systems. A chromosomal translocation involving this gene and the IgH locus, t(6;14)(p25;q32), may be a cause of multiple myeloma. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 23:52050985-52064928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 82 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
Interferon gamma signaling pathway
Interferon Signaling pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
IL4-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BF88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 506141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.60671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206162 XM_005223855 XM_005223856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02055939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 506141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||