Bos taurus Gene: TPR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-637580.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TPR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nucleoprotein TPR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000011943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
translocated promoter region (to activated MET oncogene)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000047410:
This gene encodes a large coiled-coil protein that forms intranuclear filaments attached to the inner surface of nuclear pore complexes (NPCs). The protein directly interacts with several components of the NPC. It is required for the nuclear export of mRNAs and some proteins. Oncogenic fusions of the 5' end of this gene with several different kinase genes occur in some neoplasias. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a large coiled-coil protein that forms intranuclear filaments attached to the inner surface of nuclear pore complexes (NPCs). The protein directly interacts with several components of the NPC. It is required for the nuclear export of mRNAs and some proteins. Oncogenic fusions of the 5\' end of this gene with several different kinase genes occur in some neoplasias. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:68886195-68949366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 62 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
ISG15 antiviral mechanism pathway
Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein pathway
Glucose transport pathway
Hexose transport pathway
Nuclear import of Rev protein pathway
Vpr-mediated nuclear import of PICs pathway
Rev-mediated nuclear export of HIV RNA pathway
Viral Messenger RNA Synthesis pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Influenza Infection pathway
Interactions of Vpr with host cellular proteins pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
Antiviral mechanism by IFN-stimulated genes pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
Transcriptional regulation by small RNAs pathway
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Interferon Signaling pathway
Cell Cycle pathway
Immune System pathway
M Phase pathway
HIV Life Cycle pathway
Mitotic Prophase pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
HIV Infection pathway
Influenza Life Cycle pathway
Metabolism pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Interactions of Rev with host cellular proteins pathway
Gene Expression pathway
Nuclear Envelope Breakdown pathway
Disease pathway
Glycogen storage diseases pathway
Regulatory RNA pathways pathway
Nuclear Envelope Breakdown pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Disease pathway
Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein pathway
Cell Cycle pathway
Metabolism pathway
M Phase pathway
Transcriptional regulation by small RNAs pathway
Glucose transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Hexose transport pathway
Glycogen storage diseases pathway
Gene Expression pathway
Regulatory RNA pathways pathway
Mitotic Prophase pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
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KEGG |
Thyroid cancer pathway
Pathways in cancer pathway
RNA transport pathway
Thyroid cancer pathway
Pathways in cancer pathway
RNA transport pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BF47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 507869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.1386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205623 XM_005217337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02043627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 507869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||