Bos taurus Gene: PMS2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640975.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PMS2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | mismatch repair endonuclease PMS2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000007364 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PMS2 postmeiotic segregation increased 2 (S. cerevisiae)
PMS2 postmeiotic segregation increased 2 (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000122512:
This gene is one of the PMS2 gene family members found in clusters on chromosome 7. The product of this gene is involved in DNA mismatch repair. It forms a heterodimer with MLH1 and this complex interacts with other complexes bound to mismatched bases. Mutations in this gene are associated with hereditary nonpolyposis colorectal cancer, Turcot syndrome, and are a cause of supratentorial primitive neuroectodermal tumors. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 25:38559729-38575940 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 42 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) pathway
Mismatch Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Mismatch repair pathway
Mismatch repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI |
Direct p53 effectors
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Bt.38732 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205938 XM_005225133 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||