Bos taurus Gene: C20ORF18 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-641465.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | C20ORF18 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ranBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | C20ORF18 | ||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017002 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ranBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] RBCK1 (LUBAC) complexes with RNF31 and is involved in the physiological regulation of the canonical NF-kappaB activation pathway through linear polyubiquitylation of IKBKG.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000125826:
The protein encoded by this gene is similar to mouse UIP28/UbcM4 interacting protein. Alternative splicing has been observed at this locus, resulting in distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:61147247-61164402 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 61 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q1JPC8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 504400 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.12478 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001075161 XM_005214523 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | BC126562 BT025425 DAAA02036376 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI26563 ABF57381 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 504400 | ||||||||||||||||||||||