Bos taurus Gene: ALS2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-643258.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ALS2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000007395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000003393:
The protein encoded by this gene contains an ATS1/RCC1-like domain, a RhoGEF domain, and a vacuolar protein sorting 9 (VPS9) domain, all of which are guanine-nucleotide exchange factors that activate members of the Ras superfamily of GTPases. The protein functions as a guanine nucleotide exchange factor for the small GTPase RAB5. The protein localizes with RAB5 on early endosomal compartments, and functions as a modulator for endosomal dynamics. Mutations in this gene result in several forms of juvenile lateral sclerosis and infantile-onset ascending spastic paralysis. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:90664833-90712586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.110729 Bt.110849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002685510 XM_005199635 XM_005199636 XM_005202685 XM_005202686 XM_615861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||