Bos taurus Gene: BRMS1 | |||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644383.3 | ||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||
Gene Symbol | BRMS1 | ||||||||||||||||
Gene Name | Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog | ||||||||||||||||
Synonyms | BRMS1L | ||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000017689 | ||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog
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Protein Structure | |||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000174744:
This gene reduces the metastatic potential, but not the tumorogenicity, of human breast cancer and melanoma cell lines. The protein encoded by this gene localizes primarily to the nucleus and is a component of the mSin3a family of histone deacetylase complexes (HDAC). The protein contains two coiled-coil motifs and several imperfect leucine zipper motifs. Alternative splicing results in two transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 29:45035736-45042778 | ||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 25 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||
REACTOME |
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
HDACs deacetylate histones pathway
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KEGG | |||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||
SwissProt | Q1LZE0 | ||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||
Entrez Gene | 615952 | ||||||||||||||||
UniGene | Bt.28488 | ||||||||||||||||
RefSeq | NM_001076404 | ||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||
EMBL | BC116061 | ||||||||||||||||
GenPept | AAI16062 | ||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 615952 | ||||||||||||||||