Bos taurus Gene: SEMA3F | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-645842.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEMA3F | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000018307 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000001617:
The semaphorins are a family of proteins that are involved in signaling. All the family members have a secretion signal, a 500-amino acid sema domain, and 16 conserved cysteine residues (Kolodkin et al., 1993 [PubMed 8269517]). Sequence comparisons have grouped the secreted semaphorins into 3 general classes, all of which also have an immunoglobulin domain. The semaphorin III family, consisting of human semaphorin III (SEMA3A; MIM 603961), chicken collapsin, and mouse semaphorins A, D, and E, all have a basic domain at the C terminus. Chicken collapsin contributes to path finding by axons during development by inhibiting extension of growth cones (Luo et al., 1993 [PubMed 8402908]) through an interaction with a collapsin response mediator protein of relative molecular mass 62K (CRMP62) (Goshima et al., 1995 [PubMed 7637782]), a putative homolog of an axonal guidance associated UNC33 gene product (MIM 601168). SEMA3F is a secreted member of the semaphorin III family.[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:50733157-50756457 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Axon guidance pathway
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MGN0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 531141 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002697033 XM_609627 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10728 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02054414 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 531141 | ||||||||||||||||||||||||||||||