Bos taurus Gene: MSH3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-646483.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MSH3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA mismatch repair protein Msh3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000007684 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA mismatch repair protein Msh3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000113318:
The protein encoded by this gene forms a heterodimer with MSH2 to form MutS beta, part of the post-replicative DNA mismatch repair system. MutS beta initiates mismatch repair by binding to a mismatch and then forming a complex with MutL alpha heterodimer. This gene contains a polymorphic 9 bp tandem repeat sequence in the first exon. The repeat is present 6 times in the reference genome sequence and 3-7 repeats have been reported. Defects in this gene are a cause of susceptibility to endometrial cancer. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:83040940-83227242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 20 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) pathway
Mismatch Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
Colorectal cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.14254 Bt.63530 Bt.90094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001102305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||