Homo sapiens Gene: KDM5C | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-69550.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM5C | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 5C | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | DXS1272E; JARID1C; MRX13; MRXJ; MRXSCJ; MRXSJ; SMCX; XE169 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000126012 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 5C
lysine (K)-specific demethylase 5C
lysine (K)-specific demethylase 5C
lysine (K)-specific demethylase 5C
lysine (K)-specific demethylase 5C
lysine (K)-specific demethylase 5C
lysine (K)-specific demethylase 5C
lysine (K)-specific demethylase 5C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the SMCY homolog family and encodes a protein with one ARID domain, one JmjC domain, one JmjN domain and two PHD-type zinc fingers. The DNA-binding motifs suggest this protein is involved in the regulation of transcription and chromatin remodeling. Mutations in this gene have been associated with X-linked mental retardation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:53191321-53225422 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p11.22 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 31 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P41229 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8242 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.631768 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001282622 NM_001146702 NM_004187 XM_005262035 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11114 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 314690 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS65269 CCDS14351 CCDS55417 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02442 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK304732 AL139396 BC054499 CH471154 L25270 Z29650 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA61302 AAH54499 BAG65494 CAA82758 CAI39836 CAI39837 CAI39838 EAW93145 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8242 | ||||||||||||||||||||||