Homo sapiens Gene: NCAM1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-71584.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NCAM1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | neural cell adhesion molecule 1 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD56; MSK39; NCAM | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000149294 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
neural cell adhesion molecule 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a cell adhesion protein which is a member of the immunoglobulin superfamily. The encoded protein is involved in cell-to-cell interactions as well as cell-matrix interactions during development and differentiation. The encoded protein has been shown to be involved in development of the nervous system, and for cells involved in the expansion of T cells and dendritic cells which play an important role in immune surveillance. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:112961247-113278436 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.2 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon gamma signaling pathway
Signal transduction by L1 pathway
L1CAM interactions pathway
NCAM1 interactions pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Developmental Biology pathway
Extracellular matrix organization pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Axon guidance pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
ECM proteoglycans pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Prion diseases pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
FGF signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4684 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001242607 NM_000615 NM_001076682 NM_001242608 NM_181351 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7656 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 116930 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS73384 CCDS73385 CCDS73386 CCDS73387 CCDS73388 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 4684 | ||||||||||||||||||||||||||