Homo sapiens Gene: APEX2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-72022.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | APEX2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | APEX nuclease (apurinic/apyrimidinic endonuclease) 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000169188 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
APEX nuclease (apurinic/apyrimidinic endonuclease) 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
Apurinic/apyrimidinic (AP) sites occur frequently in DNA molecules by spontaneous hydrolysis, by DNA damaging agents or by DNA glycosylases that remove specific abnormal bases. AP sites are pre-mutagenic lesions that can prevent normal DNA replication so the cell contains systems to identify and repair such sites. Class II AP endonucleases cleave the phosphodiester backbone 5' to the AP site. This gene encodes a protein shown to have a weak class II AP endonuclease activity. Most of the encoded protein is located in the nucleus but some is also present in mitochondria. This protein may play an important role in both nuclear and mitochondrial base excision repair. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:55000357-55009057 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | p11.21 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Base excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.555936 Hs.659558 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_014481 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14365 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06442 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||