Homo sapiens Gene: TRIM28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-73191.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif containing 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | KAP1; PPP1R157; RNF96; TF1B; TIF1B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000130726 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif containing 28
tripartite motif containing 28
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
TRIM28 interacts with IRF5 and mediates heterochromatinization at M1 macrophage markers (e.g. TNF) to suppress transcription.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene mediates transcriptional control by interaction with the Kruppel-associated box repression domain found in many transcription factors. The protein localizes to the nucleus and is thought to associate with specific chromatin regions. The protein is a member of the tripartite motif family. This tripartite motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:58544091-58550722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 271 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 19 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Generic Transcription Pathway pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
p53 pathway
C-MYB transcription factor network
E2F transcription factor network
ATM pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | M0QZE6 M0R0K9 M0R2I3 M0R3C0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.467408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC016630 BC004978 BC007390 BC052986 U31657 U78773 U95040 X97548 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA74954 AAB37341 AAB51517 AAH04978 AAH07390 AAH52986 CAA66150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||