Homo sapiens Gene: ITGB6 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-73389.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | ITGB6 | ||||||||||||||||||
Gene Name | integrin, beta 6 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000115221 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin, beta 6
integrin, beta 6
integrin, beta 6
integrin, beta 6
integrin, beta 6
integrin, beta 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that is a member of the integrin superfamily. Members of this family are adhesion receptors that function in signaling from the extracellular matrix to the cell. Integrins are heterodimeric integral membrane proteins composed of an alpha chain and a beta chain. The encoded protein forms a dimer with an alpha v chain and this heterodimer can bind to ligands like fibronectin and transforming growth factor beta 1. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:160099666-160271888 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q24.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Integrin cell surface interactions pathway
Molecules associated with elastic fibres pathway
Elastic fibre formation pathway
Extracellular matrix organization pathway
ECM proteoglycans pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Integrin family cell surface interactions
Beta5 beta6 beta7 and beta8 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.470399 Hs.622941 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000888 NM_001282353 NM_001282354 NM_001282355 NM_001282388 NM_001282389 NM_001282390 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2212 CCDS63040 CCDS74596 CCDS74597 | ||||||||||||||||||
HPRD | 00947 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||