Homo sapiens Gene: PRPF6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-87633.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PRP6 pre-mRNA processing factor 6 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ANT-1; ANT1; C20orf14; hPrp6; Prp6; RP60; SNRNP102; TOM; U5-102K | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000101161 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PRP6 pre-mRNA processing factor 6 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene appears to be involved in pre-mRNA splicing, possibly acting as a bridging factor between U5 and U4/U6 snRNPs in formation of the spliceosome. The encoded protein also can bind androgen receptor, providing a link between transcriptional activation and splicing. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:63981135-64033100 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 99 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O94906 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 24148 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.31334 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_012469 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15860 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 613979 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13550 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB019219 AF026031 AF221842 AK001554 AK314310 AL118506 AL137320 AL355803 AL356790 BC001666 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD01798 AAF66128 AAH01666 BAA37140 BAG36962 BAG50938 CAB70695 CAC16610 CAH71582 CAI21906 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 24148 | ||||||||||||||||||||||