Homo sapiens Gene: NFKB2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-87893.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NFKB2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CVID10; H2TF1; LYT-10; LYT10; NF-kB2; p100; p52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000077150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100)
nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100)
nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100)
nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
NFKB2 (p49/p100 subunit) associates efficiently with RELB and up-regulates the synthesis of NFKBIA (IKappaB-alpha).
NFKB2 plays a key role in the regulation of RELA activation, suggesting an overlap in the function of NF-kappaB members in canonical and non-canonical pathway signalling.
NFKB2 rearrangement gene product (p58) localizes in the nucleus to form a complex with RELA or RELB, suggesting that such NFKB2 gene rearrangement may therefore be a factor in the constitutive activation of NF-kappaB in adult T-cell leukemia (ATL), and thereby playing a role in the ATL pathogenesis.
NFKB2 negatively regulates TCR signaling by binding with RELA, RELB, REL and NFKB1 (p50) in the cytoplasm and inhibiting these proteins from entering nucleus.
NFKB2 limits TNF-induced bone resorption in mice by a TRAF3-dependent mechanism.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Bacterial cell wall glucosaminyl-muramyl dipeptides (GMDPs) bind to the transcription factor Ybx1 to upregulate Nfkb2 and Cxcr4 gene expression.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes one of the subunits of the transcription factor complex nuclear factor-kappa-B (NFkB). The NFkB transcription factor complex is expressed in numerous cell types and functions as a central activator of genes involved in inflammation and immune function. The NFkB complex can consist of different subunits that form both homo- or heterodimers which bind specific kappa-B elements in target genes. This gene encodes the p100 subunit that is processed into the active p52 subunit. This protein can function as both a transcriptional activator and repressor, depending on its dimer partner. Alternate splicing results in both coding and non-coding variants. [provided by RefSeq, May 2012] This gene encodes a subunit of the transcription factor complex nuclear factor-kappa-B (NFkB). The NFkB complex is expressed in numerous cell types and functions as a central activator of genes involved in inflammation and immune function. The protein encoded by this gene can function as both a transcriptional activator or repressor depending on its dimerization partner. The p100 full-length protein is co-translationally processed into a p52 active form. Chromosomal rearrangements and translocations of this locus have been observed in B cell lymphomas, some of which may result in the formation of fusion proteins. There is a pseudogene for this gene on chromosome 18. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:102394110-102402529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q24.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 123 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
RANKL pathway
TSLP pathway
TWEAK pathway
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REACTOME |
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 pathway
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs pathway
TRAF6 mediated NF-kB activation pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
TAK1 activates NFkB by phosphorylation and activation of IKKs complex pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
Interleukin-1 processing pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Activated TLR4 signalling pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG |
MAPK signaling pathway pathway
Pathways in cancer pathway
Osteoclast differentiation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
IL12-mediated signaling events
Alternative NF-kappaB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.73090 Hs.742532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001077494 NM_001261403 NM_001288724 NM_002502 XM_005269860 XM_005269861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41564 CCDS41565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||