Homo sapiens Gene: ABLIM1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-90406.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ABLIM1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | actin binding LIM protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ABLIM; abLIM-1; LIMAB1; LIMATIN | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000099204 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
actin binding LIM protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a cytoskeletal LIM protein that binds to actin filaments via a domain that is homologous to erythrocyte dematin. LIM domains, found in over 60 proteins, play key roles in the regulation of developmental pathways. LIM domains also function as protein-binding interfaces, mediating specific protein-protein interactions. The protein encoded by this gene could mediate such interactions between actin filaments and cytoplasmic targets. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:114431113-114685003 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q25.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
DCC mediated attractive signaling pathway
Netrin-1 signaling pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O14639 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3983 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.645719 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_005269818 XM_006717840 XM_006717841 NM_001003407 NM_001003408 NM_002313 NM_006720 XM_005269819 XM_005269820 XM_005269822 XM_005269828 XM_006717843 XM_006717844 XM_006717848 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:78 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602330 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31289 CCDS7590 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03819 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF005654 AK098277 AL133384 AL354873 AL590109 BC002448 CR749819 D31883 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC51676 AAH02448 BAA06681 BAG53605 CAH18679 CAI10908 CAI10910 CAI40135 CAI40136 CAI40140 CAI40141 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3983 | ||||||||||||||||||||||