Homo sapiens Gene: ATG5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-94856.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ATG5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | APG5; APG5-LIKE; APG5L; ASP; hAPG5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000057663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ATG5 autophagy related 5 homolog (S. cerevisiae)
ATG5 autophagy related 5 homolog (S. cerevisiae)
ATG5 autophagy related 5 homolog (S. cerevisiae)
ATG5 autophagy related 5 homolog (S. cerevisiae)
autophagy related 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
ATG5 forms a conjugate with ATG12 to directly associate with DDX58 and MAVS and negatively regulate the antiviral IFN production pathway by mediating autophagy.
ATG12::ATG5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. ATG12::ATG5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Atg12::Atg5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. Atg12::Atg5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
[Mus musculus] Atg5 knockout mice develop systemic and hepatic inflammation with high-fat diet and low-dose lipolysaccharide treatment.
[Mus musculus] Atg5 plays a unique role in protection against M. tuberculosis by preventing polymorphic mononuclear cell (PMN)-mediated immunopathology. Loss of Atg5 in PMNs can cause susceptibility to M. tuberculosis.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:106184476-106325820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 61 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Regulation of autophagy pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
Shigellosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.486063 Hs.603246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001286106 NM_001286107 NM_001286108 NM_001286111 NM_004849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5055 CCDS69159 CCDS75498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 16051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||