Homo sapiens Gene: SYNJ2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-98393.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SYNJ2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | synaptojanin 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | INPP5H | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000078269 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
synaptojanin 2
synaptojanin 2
synaptojanin 2
synaptojanin 2
synaptojanin 2
synaptojanin 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The gene is a member of the inositol-polyphosphate 5-phosphatase family. The encoded protein interacts with the ras-related C3 botulinum toxin substrate 1, which causes translocation of the encoded protein to the plasma membrane where it inhibits clathrin-mediated endocytosis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:157981887-158099176 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q25.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of PIPs at the plasma membrane pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
PI Metabolism pathway
Phospholipid metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Inositol phosphate metabolism pathway
Phosphatidylinositol signaling system pathway
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INOH |
Inositol phosphate metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8871 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.434494 Hs.616825 Hs.707706 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001178088 NM_003898 XM_005267197 XM_005267198 XM_005267199 XM_005267200 XM_006715591 XM_006715592 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11504 | ||||||||||||||||||
OMIM | 609410 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5254 | ||||||||||||||||||
HPRD | 10259 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8871 | ||||||||||||||||||