Homo sapiens Protein: VCAM1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-100527.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VCAM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | vascular cell adhesion molecule 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD106; INCAM-100; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000294728 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-100525 (VCAM1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Important in cell-cell recognition. Appears to function in leukocyte-endothelial cell adhesion. Interacts with integrin alpha-4/beta-1 (ITGA4/ITGB1) on leukocytes, and mediates both adhesion and signal transduction. The VCAM1/ITGA4/ITGB1 interaction may play a pathophysiologic role both in immune responses and in leukocyte emigration to sites of inflammation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane; Single-pass type I membrane protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed on inflammed vascular endothelium, as well as on macrophage-like and dendritic cell types in both normal and inflammed tissue. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 451 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003596
Immunoglobulin V-set, subgroup IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR003987 Intercellular adhesion molecule/vascular cell adhesion molecule, N-terminal IPR003989 Vascular cell adhesion molecule-1 IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR008424 Immunoglobulin C2-set IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013151 Immunoglobulin |
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PFAM |
PF05790
PF07679 PF00047 |
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PRINTS |
PR01472
PR01474 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00406
SM00408 SM00409 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P19320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P19320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q68DC4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.708046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 192225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC093428 AF536818 AK291732 AK296692 BC017276 BC068490 BC085003 CH471097 CR749464 JF271680 JF280676 JF699680 JF907575 JF917093 M30257 M60335 M73255 M92431 X53051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA51917 AAA61269 AAA61270 AAH17276 AAH68490 AAH85003 AAM96190 ADZ72971 AEH21939 AEH21940 AEL21381 AEL30503 BAF84421 BAG59286 CAA37218 CAH18296 EAW72950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||