Homo sapiens Protein: OBSCN | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-107224.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | OBSCN | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000284548 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-107220 (OBSCN) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in myofibrillogenesis. Seems to be involved in assembly of myosin into sarcomeric A bands in striated muscle. Isoform 3 together with ANK1 isoform Mu17/Ank1.5 may provide a molecular link between the sarcoplasmic reticulum and myofibrils. {ECO:0000269PubMed:11448995, ECO:0000269PubMed:16205939}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 3: Cytoplasm, myofibril, sarcomere, M line. Cytoplasm, myofibril, sarcomere, Z line. Note=In differentiating skeletal muscle cells, isoform 3 primarily localizes to the sarcomeric M-line and less frequently to the Z- disk. Isoform 3 colocalizes with ANK1 isoform Mu17/ank1.5 at the M-line in differentiated skeletal muscle cells. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Note=A chromosomal aberration involving OBSCN has been found in Wilms tumor. Translocation t(1;7)(q42;p15) with PTHB1. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000048
IQ motif, EF-hand binding site IPR000219 Dbl homology (DH) domain IPR001452 SH3 domain IPR001849 Pleckstrin homology domain IPR003596 Immunoglobulin V-set, subgroup IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR003961 Fibronectin, type III IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin |
||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00612
PF00621 PF00018 PF14604 PF00169 PF00041 PF01108 PF07679 PF07686 PF00047 |
||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00452
|
||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00015
SM00325 SM00326 SM00233 SM00406 SM00408 SM00409 SM00060 |
||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q5VST9 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q5VST9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8W8T3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 84033 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_443075 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15719 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 608616 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1570 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10551 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB046776 AB046859 AJ002535 AJ314896 AJ314898 AJ314900 AJ314901 AJ314903 AJ314904 AJ314905 AJ314906 AJ314907 AJ314908 AL353593 AL359510 AL670729 AM231061 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAB13382 BAB13465 CAC44768 CAC85745 CAC85746 CAC85747 CAC85749 CAC85750 CAC85751 CAC85752 CAC85753 CAC85754 CAC85755 CAH71670 CAH71673 CAI15072 CAI19283 CAI19284 CAI19285 CAJ76912 | ||||||||||||||||||||||